9.10: Investigar homólogos de S. pombe usando Pombase
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Al igual que S. cerevisiae, S. pombe es un organismo modelo con una gran comunidad propia de investigadores. Pombase sirve como base de datos central de información sobre S. pombe, funcionando de manera muy parecida a la SGD. Accede a Pombase en http://www.pombase.org
- Ingresa el nombre para el homólogo de S. pombe que obtuviste en Homólogo.
- Registre el nombre sistemático de su gen, que se refiere a la posición del gen en el cromosoma. Los nombres sistemáticos comienzan con SPAC, SPBC o SPCC, correspondientes a los cromosomas I, II y III, respectivamente.
- Pombase almacena toda la información en una sola página que se divide en campos. Los campos individuales se pueden expandir o minimizar con una flecha por el nombre del campo. Los enlaces rápidos en la parte inferior derecha también ayudan con la navegación.
- Navega al campo Transcipto. El gráfico indicará si el homólogo contiene un intrón. El campo también contiene información sobre los límites exón/intrón y la información sobre las UTR 5' y 3'-en los ARNm, cuando esa información está disponible. ¿El homólogo de su gen MET contiene intrones?
- Dedique un poco de tiempo a ver qué tipo de información (por ejemplo, el tamaño gene/proteína, la función, las interacciones de proteínas) está disponible para su ortólogos de S. pombe. Puede que Pombase sea un recurso útil a la hora de escribir informes de laboratorio.