10.S: Introducción a los modelos de nacimiento-muerte (Resumen)

Última actualización
Guardar como PDF

Page ID: 53907

\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)\(\newcommand{\AA}{\unicode[.8,0]{x212B}}\)

En este capítulo, introduje modelos de nacimiento-muerte y resumí sus propiedades matemáticas básicas. Los modelos de nacimiento-muerte predicen patrones de diversidad de especies a lo largo de intervalos de tiempo, y también pueden usarse para modelar el crecimiento de árboles filogenéticos. Podemos visualizar estos patrones midiendo el balance de árboles y creando gráficas de linaje a través del tiempo (LTT).

Referencias

Bailey, N. T. J. 1964. Los elementos de los procesos estocásticos con aplicaciones a las ciencias naturales. John Wiley & Hijos.

Bell, C. D., D. E. Soltis, y P. S. Soltis. 2005. La edad de las angiospermas: Una escala de tiempo molecular sin reloj. Evolución 59:1245 —1258.

Colless, D. H. 1982. Revisión de filogenética: La teoría y práctica de la sistemática filogenética. Syst. Zool.

Crepet, W. L., y K. J. Niklas. 2009. El segundo “misterio abominable” de Darwin: ¿Por qué hay tantas especies de angiospermas? Am. J. Bot. Soc Botánico América.

Davies, T. J., T. G. Barraclough, M. W. Chase, P. S. Soltis, D. E. Soltis, y V. Savolainen. 2004. El abominable misterio de Darwin: Insights de un superárbol de las angiospermas. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 101:1904 —1909.

Farris, J. S. 1976. Asimetría esperada de árboles filogenéticos. Syst. Zool. 25:196 —198. [Oxford University Press, Sociedad de Biólogos Sistemáticos, Taylor & Francis, Ltd.].

Felsenstein, J. 2004. Inferir filogenias. Sinauer Associates, Inc., Sunderland, MA.

Foote, M., J. P. Hunter, C. M. Janis, y J. J. Sepkoski Jr. 1999. Restricciones evolutivas y conservacionales sobre los orígenes de grupos biológicos: Tiempos de divergencia de mamíferos euterianos. Ciencia 283:1310 —1314.

Hedges, S. B., J. Dudley, y S. Kumar. 2006. TimeTree: Una base de conocimiento público de tiempos de divergencia entre organismos. Bioinformática 22:2971 —2972.

Kot, M. 2001. Procesos estocásticos de nacimiento y muerte. Pág. 25—42 en M. Kot, ed. Elementos de la ecología matemática. Prensa de la Universidad de Cambridge, Cambridge.

Mooers, A. O., y S. B. Oído. 1997. Inferir proceso evolutivo a partir de la forma del árbol filogenético. P. Rev. Biol. 72:31 —54.

Raup, D. M. 1985. Modelos matemáticos de cladogénesis. Paleobiología 11:42 —52.

Slowinski, J. B., y C. Guyer. 1993. Probar si ciertos rasgos han causado diversificación amplificada: Un método mejorado basado en un modelo de especiación y extinción aleatorias. Am. Nat. 142:1019 —1024.

Stadler, T. 2011. Simulación de árboles con un número fijo de especies existentes. Syst. Biol. 60:676 —684.