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5: Introducción a las bases de datos

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    La computadora pertenece a la mesa en el moderno laboratorio de biología, junto con otros equipos esenciales. Una red de bases de datos en línea proporciona a los investigadores un acceso rápido a información sobre genes, proteínas, fenotipos y publicaciones. En este laboratorio, recopilará información sobre un gen MET de una variedad de bases de datos.


    Objetivos

    Al final de este laboratorio, los estudiantes deben ser capaces de:

    • explicar cómo la información es enviada y procesada por las bases de datos biológicas.
    • utilizar bases de datos NCBI para obtener información sobre genes específicos y las proteínas codificadas por esos genes.
    • describir los procesos computacionales utilizados por los proyectos genómicos para decodificar secuencias de ADN y procesar la información para bases de datos moleculares.
    • utilizar la base de datos del genoma de Saccharomyces para obtener información sobre el papel o roles que desempeñan las proteínas específicas en el metabolismo de la levadura y las consecuencias fenotípicas de alterar la función de la proteína.

    La investigación biomédica se ha transformado en los últimos 25 años por los rápidos avances en tecnologías de secuenciación de ADN, robótica y capacidad informática. Estos avances han marcado el comienzo de una era de ciencia de alto rendimiento, que está generando una gran cantidad de información sobre los sistemas biológicos. Esta explosión de información ha estimulado el desarrollo de la bioinformática, un campo interdisciplinario que requiere habilidades en matemáticas, informática y biología. Los bioinformáticos desarrollan herramientas computacionales para recopilar, organizar y analizar una amplia variedad de datos biológicos que se almacenan en una variedad de bases de datos de búsqueda. El biólogo actual necesita estar familiarizado con las bases de datos en línea y ser competente en la búsqueda de información en bases de datos.

    A tu equipo se le han dado tres cepas de S. cerevisiae, a cada una de las cuales le falta un gen MET. En los próximos laboratorios, determinará qué gen MET se elimina en cada cepa. Para identificar las cepas, necesitará información sobre las secuencias del gen MET que han sido alteradas en las cepas mutantes. También necesitarás información sobre el papel que juega cada una de las proteínas codificadas en la síntesis de metionina. En este laboratorio, buscará esa información específica del gen en varias bases de datos en línea. Cada miembro del grupo debe investigar uno diferente de los tres genes MET. A medida que avanza en este laboratorio, puede sentir que va en círculos a veces, ¡porque lo está! Los registros en las bases de datos están ampliamente hipervinculados entre sí, por lo que a menudo encontrará el mismo registro a través de múltiples rutas. Mientras trabaja en este capítulo, le recomendamos que registre sus resultados de búsqueda directamente en este manual de laboratorio.


    This page titled 5: Introducción a las bases de datos is shared under a CC BY-NC-SA license and was authored, remixed, and/or curated by Clare M. O’Connor.