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6.2: Nomenclatura genética

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    Al referirse a genes y cepas, es importante utilizar una nomenclatura genética correcta. Presta mucha atención a las cursivas y mayúsculas mientras preparas tus informes.
    Los nombres de los genes se colocan en cursiva, mientras que las proteínas y fenotipos se refieren con fuente normal. Los nombres de genes que comienzan con mayúsculas se refieren a alelos dominantes, mientras que los nombres de genes que comienzan con letras minúsculas se refieren a alelos recesivos. (Una rareza sobre la levadura en ciernes: los nombres de genes de S. cerevisiae son únicos, ya que los alelos dominantes se describen con tres letras mayúsculas. En la mayoría de las otras especies eucariotas, los alelos dominantes serían referidos como Met6 con solo la primera letra en mayúscula). Los nombres de los genes de S. cerevisiae constan de tres letras, seguidas de un número.
    Puede haber muchos nombres de genes diferentes que comiencen con las mismas tres letras, por ejemplo, hay más de 20 genes MET diferentes, pero el número al final del nombre del gen es específico para un gen en particular. Si se dispone de algún detalle molecular para un alelo mutante en particular, el número puede ir seguido de un guión e información adicional sobre el alelo.

    Como ejemplo, veamos la nomenclatura que se utilizaría para el gen MET6 de S. cerevisiae. El prefijo met se utiliza para describir alelos de pérdida de función encontrados en cepas mutantes, la mayoría de las cuales fueron aisladas en cribas genéticas basadas en su incapacidad para vivir en ausencia de Met. Los números asociados a los genes suelen ser arbitrarios. El gen MET6 adquirió su nombre antes de que su producto génico hubiera sido identificado como homocisteína metiltransferasa, último paso en la síntesis de metionina. La siguiente lista describe las convenciones de nomenclatura para genes, proteínas y cepas relacionadas con MET6 de S. cerevisiae. Estas mismas reglas se aplican para otros genes en S. cerevisiae.

    MET6 Alelo dominante del gen MET6 o del locus cromosómico

    met6 Alelo recesivo del gen MET6 (alelo encontrado en un mutante met6)

    met6-12 Alelo recesivo: el número después de los paréntesis se refiere a una mutación específica

    met6-∆1 Alelo recesivo - el alelo met6 tiene una deleción específica (indica una deleción)

    met6: :LEU2 Alelo recesivo -inserción de un gen LEU2 dominante en el locus MET6 en el cromosoma ha inactivado el gen MET6 huésped

    Proteína Met6p codificada por el gen MET6, es decir, homocisteína metiltransferasa

    Estaremos trabajando con cepas haploides de levadura en este curso. Para escribir el genotipo de una cepa en particular, comience con el tipo de apareamiento y síguelo con los alelos mutantes en la cepa. Por ejemplo, estamos usando cepas met construidas insertando un gen bacteriano de resistencia a kanamicina (KAN R) en la cepa de levadura BY4742, que tiene el tipo de apareamiento y porta mutaciones
    en genes involucrados en la síntesis de histidina, leucina, lisina y uracilo. BY4742 se deriva de la cepa S288C, la cual se utilizó para el proyecto del genoma (Brachmann et al. , 1998). Así, el genotipo de nuestro mutante met6 incluiría las mutaciones BY4742 y estaría escrito:

    MAT\(\alpha\) his3-∆1 leu2∆0 lys2∆0 ura3∆0 met6:: KAN R


    This page titled 6.2: Nomenclatura genética is shared under a CC BY-NC-SA license and was authored, remixed, and/or curated by Clare M. O’Connor.