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10.6: Gráficas de linaje a través del tiempo

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    53851
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    La otra forma principal de cuantificar la forma filogenética de los árboles es haciendo parcelas de linaje a través del tiempo. Estas parcelas tienen tiempo a lo largo del eje x (desde la raíz del árbol hasta la actualidad), y el número reconstruido de linajes en el eje y (Figura 10.8). Dado que generalmente estamos considerando modelos de nacimiento-muerte, donde se espera que el número de linajes crezca (o se reduzca) exponencialmente a través del tiempo, entonces es una práctica típica transformar logarítmica el eje y.

    Figura 10.9. Gráfica de linaje a través del tiempo. Imagen del autor, puede ser reutilizada bajo licencia CC-BY-4.0.
    Figura 10.9. Gráfica de linaje a través del tiempo. Imagen del autor, puede ser reutilizada bajo licencia CC-BY-4.0.

    Las gráficas de linaje a través del tiempo son formas efectivas de visualizar patrones de diversificación de linaje a través del tiempo. Bajo un modelo de nacimiento puro en escala semi-logarítmica, las parcelas LTT siguen una línea recta en promedio (Figura 10.9A). Por el contrario, la extinción debería dejar una señal clara en las parcelas LTT porque la probabilidad de que un linaje se extinga depende de cuánto tiempo haya existido; los linajes viejos tienen muchas más probabilidades de haber sido golpeados por la extinción que los linajes relativamente jóvenes. Esto lo vemos reflejado en las gráficas LTT como el “tirón del presente”, un repunte en la pendiente de la parcela LTT cerca de la actualidad (Figura 10.9B). El muestreo incompleto, es decir, no muestrear todas las especies vivas en un clado, también puede tener un gran impacto en la forma de las parcelas LTT (Figura 10.9C). Discutiremos las parcelas LTT más adelante en el capítulo 11, donde las usaremos para hacer inferencias sobre patrones de diversificación de linajes a través del tiempo.

    Figura 10.10. Ejemplo de parcelas de linaje a través del tiempo. Imagen del autor, puede ser reutilizada bajo licencia CC-BY-4.0.
    Figura 10.10. Ejemplo de parcelas de linaje a través del tiempo. Imagen del autor, puede ser reutilizada bajo licencia CC-BY-4.0.

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