7.3: Ejercicio 1 - Propiedades físicas de los cebadores de PCR

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La siguiente tabla enumera los pares de cebadores utilizados por el SGDP para analizar los mutantes de deleción. Al diseñar los cebadores, los investigadores buscaron pares de cebadores que tuvieran propiedades físicas similares, es decir, longitud y T _m, y generarían productos de PCR que tenían varios cientos de pares de bases de longitud. Como la mayoría de los genomas, el genoma de S. cerevisiae tiene regiones tanto ricas en AT como ricas en GC (Goffeau et al. , 1996). Las regiones no codificantes, en particular, tienden a enriquecerse en pares de bases AT, que se estabilizan por menos enlaces de hidrógeno que los pares GC.

Nota

Las secuencias de los cebadores están escritas en fuente Courier, una fuente no proporcional que a menudo se usa para los ácidos nucleicos, porque todas las letras tienen el mismo ancho. ¿Qué es inmediatamente evidente sobre las longitudes de la imprimación?

En este laboratorio, utilizará los cebadores SGDP para identificar sus tres cepas de deleción. Rellene la siguiente tabla con información sobre la longitud, contenido de GC y Tm para los cebadores diseñados para su cepa. Para encontrar esta información, utilice una de varias herramientas en línea para el análisis de cebadores:

www.IDTDNA.COM/Analyzer/Appli... OligoAnalyzer/ http://www.basic.northwestern.edu/bi...oligocalc.html