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19.7: Lectura adicional, herramientas y técnicas

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    Hay varios trabajos interesantes que están analizando los estados de la cromatina y la epigenética en general. A continuación se enumeran varias URL para comenzar su exploración:

    1. www.nature.com/nmeth/journal/... meth.1673.html
    2. www.nature.com/nature/journal... ture09906.html
    3. www.nature.com/nbt/journal/v2... /nbt.1662.html
    4. http://www.nytimes.com/2012/09/09/op...tter.html? _r=1 5. www.nature.com/doifinder/10.1038/naturaleza14248

    Se trata de algunas publicaciones seleccionadas que tratan sobre la epigenética y la enfermedad.

    1. www.nature.com/nature/journal... ture02625.html 2. http://www.sciencedirect.com/science...11124712003725
    3. www.nature.com/nbt/journal/v2... f/nbt.1685.pdf

    Herramientas y Técnicas

    ChromHmm es el HMM descrito en el texto. Está disponible para su descarga gratuita con instrucciones y ejemplos en: http://compbio.mit.edu/ChromHMM/.

    Segway es otro método para analizar múltiples pistas de datos de genómica funcional. Utiliza una red bayesiana dinámica (los HMM son un tipo particular de red bayesiana dinámica) que le permite analizar todo el genoma a una resolución de 1 pb. El inconveniente es que es mucho más lento que ChromHmm. Está disponible de forma gratuita para su descarga aquí: http://noble.gs.washington.edu/proj/segway/.


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