16.7: Informe final de laboratorio

El objetivo de nuestra clase es determinar si los ortólogos de S. pombe de los genes MET de S. cerevisiae pueden complementar deficiencias en cepas met de S. cerevisiae. Durante el semestre, has estado recopilando datos y organizando los datos en cifras y tablas. Usted ensamblará estos proyectos de versiones en un informe final. Es de esperar que los datos formen una buena historia que responda a su pregunta de investigación y/o sugiera experimentos adicionales.

El informe final deberá ser en forma de publicación científica, que incluya las secciones numeradas a continuación. A diferencia de los mini-informes, las secciones de Resultados y Discusión del informe final deben estar separadas. Mientras escribes, ¡ten en cuenta que la buena escritura científica es precisa y concisa! En el mundo profesional, las revistas proporcionan un incentivo económico para la brevedad al cobrar cargos de página a los autores: ¡cuanto más largo sea el informe, mayores serán los costos de página para los autores! Tenga cuidado de observar el máximo de página para cada sección.

Los experimentos a incluir en el informe final incluyen:

• Crecimiento de sus cepas en medios selectivos
• PCR de colonias de levadura
• Mapa de restricción de sus plásmidos de sobreexpresión
• Placas de réplica de cepas transformadas
• Análisis SDS-PAGE y Western blot de extractos celulares
• Experimento independiente (colocado donde sea más apropiado dentro del texto)

Le invitamos a cortar y pegar de sus micro-informes anteriores. Después de todo, ¡es tu trabajo y eres bienvenido a reproducirlo! Al hacerlo, tenga bien aconsejado incorporar las sugerencias de su TA para mejorar la presentación. Los únicos datos que deben incluirse en el informe final son los datos que su equipo ha generado. NO debe incluir datos de experimentos que hayan sido publicados por otros estudiantes en el sitio de intercambio de datos.

PORTADA

Incluya el título y resumen, así como su nombre y asignación de sección

1. Título - Describe tu proyecto en 150 caracteres o menos.

2. Resumen (1 párrafo, 150 palabras máximo) - Single-spaced
El resumen es un resumen muy breve de su trabajo que debe ser comprensible para el no experto. El resumen debe incluir los objetivos de tus experimentos, alguna mención (no descripción) de los métodos utilizados en los experimentos, un resumen sucinto de tus resultados experimentales y tus conclusiones generales. Evite detalles específicos de los experimentos. Un lector debe ser capaz de leer el resumen y comprender el experimento general y los resultados sin leer el resto del informe. Redactar el resumen DESPUÉS de que se haya completado el resto del informe.

CUERPO DEL INFORME - Doble espacio (Tenga en cuenta que esto es diferente al abstracto.)

3. Introducción (1.5-2 páginas)
La introducción proporciona el contexto a sus experimentos. ¿Cuál es el objetivo de tus experimentos? ¿Cómo encaja tu experimento con lo que ya se sabe sobre tu tema? ¿Alguien ha hecho experimentos similares a los tuyos antes? Para responder a estas preguntas, una introducción proporciona al lector información relevante derivada de la literatura científica. Discutir la función de la enzima y su conservación evolutiva. Utilice el formato de FEMS Yeast Research para insertar citas en su informe. Incluir al menos 7 citas de la literatura científica.

En el último párrafo de la introducción, dale al lector una vista previa de tu informe. Dígale al lector qué enfoques experimentales utilizó para responder a su pregunta. Termina esta sección con una o dos oraciones resumiendo tus conclusiones.

4. Materiales y Métodos (2-3 páginas)
Durante el transcurso del semestre, has utilizado una variedad de técnicas, las cuales han sido objeto de tus micro-informes. En las publicaciones, la sección de M&M suele dividirse en subsecciones, a menudo con sus propios subtítulos, reflejando los diferentes experimentos y técnicas.

El primer párrafo de una sección de M&M a menudo contiene detalles sobre los organismos utilizados en los experimentos y sus condiciones de cultivo. Cuando se utilizan levaduras y otros microorganismos para los experimentos, a menudo se incluye una tabla de genotipos. Incluir una tabla de genotipos con tabla con información de cepa y plásmido como Tabla 1. Consultar Cordente et al. (2009) por un buen ejemplo. Incluya en esta tabla las tres cepas YMP con las que trabajó al inicio del semestre. Nuestras cepas YMP fueron derivadas de la cepa BY4742, la cual tiene el genotipo Matα his3∆1 leu2∆0 ura3∆0. Cada una de las cepas YMP tiene una deleción met causada por la inserción de un gen KAN ^R. Los alelos de eliminación met deben ser referenciados como: met#:: KAN ^R. (Ver Capítulo 6.)

Los plásmidos para este reporte se basan en pYES2.1 y pBG1805, los cuales impulsan la expresión usando el promotor GAL1. Para describir estos plásmidos de sobreexpresión, utilice el formato:

PbG1805- GAL1:MET# o PyES2.1- Gal1:MET#

Resumir brevemente los métodos utilizados en los experimentos con subtítulos apropiados. Siéntase libre de cortar y pegar de micro-informes anteriores. Agrega información adicional para tu experimento independiente. Recuerda - si estás usando una técnica (o reactivo) publicada, no necesitas repetir todos los detalles en la sección de M&M. En su lugar, puede referirse al procedimiento o formulación publicada. En este curso, puedes hacer referencia a un protocolo en el manual del laboratorio, pero necesitas incluir cualquier modificación que hayas realizado a los procedimientos o recetas.

Regla empírica: Una buena sección de M&M debería proporcionar suficiente información para que un profesional capacitado reproduzca tus experimentos.

5. Resultados - (2-3 páginas, sin incluir tablas y figuras)
La sección Resultados cuenta una historia. Proporciona una breve narrativa que guía al lector a través de las figuras y tablas con los datos. Las transiciones suaves son importantes en la sección Resultados. El lector debe ser capaz de comprender el razonamiento que condujo de un experimento a otro. NO discuta los resultados en profundidad en esta sección; hay una sección de discusión separada en este informe. Proporcione lo suficiente de sus conclusiones de que la transición al siguiente experimento es lógica. Por ejemplo, sus datos de siembra selectiva influyeron en su elección de cebadores para el experimento de PCR de colonias de levadura. (Sus tablas en realidad incluyen algunas de estas conclusiones.) Debido a que en un artículo se utilizan con frecuencia diferentes tipos de experimentos, los autores suelen utilizar subtítulos en la sección Resultados.

A las figuras y tablas de los microinformes se les deben dar números que correspondan a su orden de aparición en el texto. Colocar las cifras y la tabla dentro de la sección de Resultados CERCA donde se hace referencia a ellas. (Debido a los saltos de página, no siempre es posible colocar la figura o tabla en la misma página en la que se hace referencia. NO se limite a adjuntar las tablas y cifras al final del informe. El artículo Cordente et al. (2009) proporciona ejemplos de numeración y colocación. Siga las pautas generales para los micro-informes. Recuerda que un biólogo capacitado debería ser capaz de entender tus resultados simplemente “mirando las imágenes”.

6. Discusión - máximo de 2 páginas
Nuestro objetivo este semestre fue determinar si las funciones de la proteína Met se conservaron entre

S. cerevisiae y S. pombe, utilizando la complementación para analizar la función proteica. Al redactar este informe, aborde los siguientes temas:

• ¿Observó alguna diferencia en las habilidades de los genes de S. cerevisiae y S. pombe para complementar la mutación met en su cepa? ¿Sus datos de complementación son consistentes con la conservación?
• Conciliar los datos de complementación con los resultados de SDS-PAGE y Western blot. ¿Se expresaron proteínas Met del tamaño esperado en células transformadas? ¿Cómo se relaciona la complementación con la expresión de la proteína Met?
• Si no observaste complementación, ¿fue esto por cuestiones técnicas o por divergencia proteica entre las dos levaduras? ¿Cómo probarías esto?
• ¿Cómo confirmó o amplió su experimento independiente sus resultados?
• ¿Qué experimentos adicionales se deben hacer para demostrar a la comunidad científica que la función MetXP es/no se conserva entre las dos especies de levadura?

7. Referencias - Single-spaced
Enumere las referencias usando el formato FEMS Yeast Research, como lo hizo en la asignación bibliográfica.