13: Caracteres y Tasas de Diversificación
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Muchos modelos evolutivos postulan un vínculo entre las características de las especies y la especiación, extinción o ambas. Estas hipótesis se pueden probar utilizando modelos de diversificación dependientes del estado, que consideran explícitamente la posibilidad de que los caracteres de las especies afecten sus tasas de diversificación. Los modelos dependientes del Estado tal como se implementan actualmente tienen algunos problemas potenciales, pero existen métodos para hacer frente a estas críticas. Queda por determinar la capacidad general de los modelos dependientes del estado para explicar patrones amplios de cambio evolutivo, pero representa una vía prometedora para futuras investigaciones.
- 13.1: La evolución de la autoincompatibilidad
- Algunas especies de angiospermas pueden evitar la autofecundación a través de la autoincompatibilidad. En plantas con autoincompatibilidad, el proceso por el cual el esperma se encuentra con el óvulo se interrumpe en alguna etapa si los granos de polen tienen un genotipo que es el mismo que el progenitor. Esto evita la autofecundación —y también impide la reproducción sexual con plantas que tienen el mismo genotipo (s) en los loci involucrados en el proceso.
- 13.2: Un Modelo de Diversificación Dependiente del Estado
- Los modelos que consideraremos en este capítulo incluyen la evolución de rasgos y la diversificación de linajes asociados. En el caso más simple, podemos considerar un modelo donde el personaje tiene dos estados, 0 y 1, y las tasas de diversificación dependen de esos estados. Necesitamos modelar las transiciones entre estos estados, lo que podemos hacer de manera idéntica a lo que hicimos anteriormente con un modelo de Markov en tiempo continuo.
- 13.3: Cálculo de probabilidades para modelos de diversificación dependientes del Estado
- Para calcular probabilidades de modelos de diversificación dependientes del estado, utilizamos un algoritmo de poda con cálculos que retroceden a través del árbol desde las puntas hasta la raíz. Ya hemos utilizado este enfoque para derivar probabilidades de modelos de tasa constante de nacimiento y muerte en árboles y esta derivación es similar.
- 13.4: ML y Pruebas Bayesianas para Diversificación Dependiente del Estado
- Ahora que podemos calcular la probabilidad para los modelos de diversificación dependientes del estado, la formulación de pruebas ML y Bayesianas sigue el mismo patrón que hemos encontrado antes. Para ML, algunas comparaciones están anidadas y así puedes usar pruebas de relación de verosimilitud.
- 13.5: Posibles escollos y cómo evitarlos
- La limitación más grave de los modelos dependientes del estado tal como se implementan actualmente es que consideran solo un conjunto relativamente pequeño de modelos posibles. En particular, el enfoque que describimos anteriormente compara dos modelos: primero, un modelo donde las tasas de natalidad y mortalidad son constantes y no dependen del estado del personaje; y segundo, un modelo donde las tasas de nacimiento y mortalidad dependen únicamente del estado del personaje.