2.14: Proteómica
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Un conjunto completo de genes en un organismo (un conjunto haploide).
A excepción del daño ocasional no reparado a su ADN (= mutaciones), el genoma es fijo.
Transcriptoma
La definición más común: Todas las moléculas de ARN mensajero (ARNm) transcritas del genoma.
Varía según el estado diferenciado de la célula y la actividad de los factores de transcripción que activan (y desactivan) la transcripción génica.
Hablando estrictamente, uno definiría el transcriptoma como todas las moléculas de ARN —que incluye una amplia variedad de ARN no traducido que no codifica proteínas— transcritas a partir del ADN del genoma. Ahora se piensa que ~ 75% de nuestro ADN se transcribe en ARN aunque sólo 1.5% de este es ARN mensajero para la síntesis de proteínas.
Metaboloma
Toda la maquinaria metabólica, p.
- enzimas
- coenzimas
- metabolitos pequeños, como
- los intermedios en la glucólisis y la respiración celular
- nucleótidos
presente en una celda en un momento dado.
Varía con el estado diferenciado de la célula y sus actividades actuales.
Proteoma
El proteoma es el prote en complemento del gen ome. Es bastante más complicado que el genoma porque un solo gen puede dar lugar a una serie de proteínas diferentes a través de
- empalme alternativo de los ARN pre-mensajeros (pre-ARNm)
- Edición de ARN de los ARN premensajeros
- unión de residuos de carbohidratos para formar glicoproteínas
- adición de grupos fosfato a algunos de los aminoácidos en la proteína
Si bien los humanos probablemente solo tenemos unos 21 mil genes, probablemente hagamos al menos 10 veces ese número de proteínas diferentes. La gran mayoría de nuestros genes producen pre-ARNm que se empalman de manera alternativa.
El estudio de la proteómica es importante porque las proteínas son responsables tanto de la estructura como de las funciones de todos los seres vivos. Los genes son simplemente las instrucciones para hacer proteínas. Son las proteínas las que hacen la vida.
El conjunto de proteínas dentro de una célula varía
- de un tipo celular diferenciado a otro (por ejemplo, glóbulo rojo vs linfocito) y
- de momento a momento, dependiendo de las actividades de la célula, e.g.
- preparándose para duplicar su genoma;
- reparar daños a su ADN;
- responder a un nutriente o citocina recién disponible;
- responder a la llegada de una hormona