Un enfoque (malo) para la alineación de secuencias es alinear las dos secuencias de todas las formas posibles, puntuar las alineaciones con un sistema de puntuación supuesto y determinar la alineación...Un enfoque (malo) para la alineación de secuencias es alinear las dos secuencias de todas las formas posibles, puntuar las alineaciones con un sistema de puntuación supuesto y determinar la alineación de mayor puntuación. El problema con este enfoque de fuerza bruta es que el número de alineamientos posibles crece exponencialmente con la longitud de la secuencia; y para secuencias de longitud razonable, el cálculo ya es imposible.
