El caso base consiste en emparejar las hojas del árbol génico con las hojas del árbol de la especie; el algoritmo luego progresa por los vértices del árbol génico, dibujando una relación entre el MRCA...El caso base consiste en emparejar las hojas del árbol génico con las hojas del árbol de la especie; el algoritmo luego progresa por los vértices del árbol génico, dibujando una relación entre el MRCA de todas las hojas dentro del subárbol de un vértice dado y el vértice MRCA correspondiente en el árbol de la especie.