Sección 7: ¿Qué hemos aprendido?
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Este capítulo proporciona una visión general del proyecto ENCODE que tiene como objetivo anotar todo el genoma humano. Recoge secuencias de ADN utilizando diversas técnicas experimentales como Chip-seq, RNA-seq y Cage-seq. Después de que se hayan obtenido los datos, es necesario procesarlos antes de intentar el análisis. Los datos pasan por una serie de pasos; control de calidad, llamadas pico, procesamiento IDR y filtrado de listas negras. Una vez que se ha asegurado la precisión de los datos, se pueden realizar otros análisis en forma de descubrimiento de motivos, análisis de coasociación y agregación de señales sobre elementos.