4.E: Ejercicios de Herramientas Genéticas
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La lectura de esta semana es Tres hábitos de vías de señalización altamente efectivas
Preguntas de la Guía de Lectura
La señalización activa un interruptor
1. ¿Cuáles son los tres hábitos de las vías de señalización?
2. ¿Qué es un SPRE y cuál es su significado en las vías de señalización?
3. ¿Cuál podría ser el propósito de activar experimentalmente una vía de señalización?
Insuficiencia del activador
4. Definir la insuficiencia activadora y las zonas de competencia
5. ¿Cómo explican los autores el hallazgo de que los SPRE son insuficientes in vitro, pero suficientes en células cultivadas?
Activación Cooperativa
6. ¿Qué es un activador independiente de la señal?
7. ¿Cuál es el propósito de los co-activadores?
Represión por Defecto
8. ¿Cómo resuelven los organismos en desarrollo el problema de la expresión con fugas?
9. Compara dos tipos de represión por defecto y cómo la señalización libera la represión
Consideraciones funcionales/mecaníticas/evolutivas
10. ¿Qué papel juega la modificación de la cromatina en las cascadas de transducción de señales en desarrollo?
Preguntas de discusión en clase
La señalización activa un interruptor
1. Escogió un hábito para ilustrar con un dibujo.
2. Explicar cómo Notch, Wnt y Hh logran el cambio transcripcional.
Insuficiencia del activador
3. ¿Qué quieren decir los autores cuando dicen que las vías de señalización exhiben “capacidad de respuesta transcripcional selectiva de los genes diana a la actividad de la vía”?
4. ¿De qué maneras pueden las células limitar la activación de un gen diana mediante una vía de señalización activada?
Activación Cooperativa
5. ¿Cuál es un inconveniente potencial para la activación cooperativa?
Represión por Defecto
6. Ilustrar los diferentes tipos de represión por defecto
7. Ilustrar un ejemplo de represión por defecto
Consideraciones funcionales/mecaníticas/evolutivas
8. Explicar Figura 5: ¿cómo es un resumen de la salida de los hábitos de la vía de señalización?
9. Explicar cómo Koide et al probaron si la represión por defecto está separada de la insuficiencia del activador.
Ejercicio grupal
Esta actividad del HHMI explora la evolución de los elementos cis-reguladores. Puedes completar el ejercicio sin ver la película sugerida (disponible en YouTube y en el sitio web de HHMI).
Modelado de los interruptores reguladores del gen Pitx1 en peces Stickleback