12.7: CalBug y su Rediseño de la Interfaz de Búsqueda
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Por Gracen Brilmyer, diciembre de 2014.
Visión general. El proyecto CalBug, ubicado fuera del Museo de Entomología The Essig de la Universidad de California, Berkeley, es una iniciativa de colaboración entre nueve instituciones de California con el objetivo de digitalizar más de un millón de especímenes. La digitalización implica obtener imágenes de ambos especímenes y sus etiquetas, así como almacenar la información de su colección en una base de datos. El proyecto CalBug también está intentando georreferenciar, o localizar las coordenadas originales de latitud y longitud, para estos millones de especímenes (algunos que datan del siglo XVIII) para que puedan ser mejor utilizados para la investigación. El proyecto utiliza muchos trabajadores estudiantiles, estudiantes graduados y voluntarios para capturar las imágenes y los datos. En los últimos años, ha participado en el proyecto Notes from Nature, que ayuda a conectar a los científicos ciudadanos con la investigación científica. A través de las imágenes generadas de las etiquetas de los especímenes por el equipo del Museo Essig, los científicos ciudadanos transcriben digitalmente los datos que se pueden leer de la imagen. El Essig, después de que cada etiqueta es transcrita por 24 científicos ciudadanos, ejecuta un programa R para encontrar la transcripción más precisa y transferirla a la base de datos de Essig. Estos esfuerzos combinados se han acumulado en más de 209,000 registros de especímenes y más de 400,000 imágenes y conteo. Este proyecto tiene un gran alcance y una escala cada vez mayor.
¿Qué se está organizando? Los especímenes de insectos en el proyecto CalBug se digitalizan a nivel individual, con números de identificación únicos, y continuamente se agregan nuevos registros de especímenes y sus datos asociados a la colección digital. Tanto los especímenes como sus datos están siendo organizados. Los grupos existentes de especímenes son priorizados para la digitalización y nuevos especímenes físicos son accedidos a la colección y son bases de datos a su llegada.
¿Por qué se está organizando? Los datos asociados a un espécimen individual pueden ser muy variables; sin embargo, mientras un espécimen tenga el tiempo y el lugar de su recolección (por muy vaga que sea) asociado a él, es un valioso material de investigación. Los especímenes físicos se organizan para facilitar el uso de la colección por parte del administrador de la colección. Cuando los especímenes físicos necesitan ser prestados, deben ser encontrados, empaquetados y enviados eficientemente en préstamo, por lo que la organización fastidiosa es clave a la hora de localizar miles de especímenes. La organización digital de la colección también facilita las funciones del personal del museo y del administrador de la colección al permitir una mayor interacción con la colección mediante el uso de la base de datos. La interfaz web de la colección digital, en proceso de rediseño desde el momento de escribir este artículo, hace que la colección sea accesible tanto para investigadores como para principiantes, así como para fomentar el intercambio de datos con otros repositorios de datos. Dado que los datos del espécimen siguen estándares curatoriales digitales, una interfaz web que permita que estos campos sean fácilmente buscables y navegables puede agregar al uso de la colección para un público más amplio, lo que es un impulso importante para el rediseño.
Interfaz de búsqueda web rediseñada de CalBug
¿Cuánto se está organizando? Como se discutió en la sección anterior, los especímenes y su información están sujetos a múltiples niveles de organización, y cada nivel de organización soporta un tipo diferente de usuario. Los datos del Proyecto CalBug se organizan de acuerdo con Darwin Core (DwC), un estándar “diseñado para facilitar el intercambio de información sobre la ocurrencia geográfica de especies y la existencia de especímenes en colecciones. ” 1 Ciertos atributos de espécimen tienen parámetros institucionales concretos, como números de identificación únicos e identificación taxonómica, mientras que otros tienen parámetros menos estrictos (por ejemplo, una ubicación precisa de donde se encuentra un espécimen), aunque aún deben usar campos específicos de DwC. Aunque existen taxonomías institucionales para la información asociada a la recolección e identificación de un espécimen, el diseño de la interfaz de búsqueda CalBug en la interfaz de búsqueda Figura: CalBug permite una reorganización hacia el exterior de los campos existentes.
¿Cuándo se está organizando y por quién? La categorización y organización ocurre en múltiples momentos para un espécimen. Si se identifica, el espécimen ya está insertado en el esquema de clasificación taxonómica, la jerarquía de cómo se relacionan las especies. Esta orden científica es heredada y replicada en la curación física de la colección, y los especímenes se clasifican adicionalmente (dentro de un taxón) por región geográfica. La alineación con categorías taxonómicas proporciona una jerarquía clara para clasificar y localizar especímenes físicos y, con cambios en la taxonomía que tienen que ser publicados, hace que el mantenimiento de la colección sea bastante consistente.
Los especímenes se organizan por segunda vez cuando son bases de datos, ya sea por pasantes o a través de Notas de la Naturaleza. Los datos se almacenan en una base de datos MySQL que utiliza principalmente campos DwC, una taxonomía institucional para datos de especímenes. La digitalización de especímenes, a través de la utilización de la semántica institucional de DwC, facilita el mantenimiento de la colección, la gobernanza y la interacción, ya que el gestor de colecciones puede buscar de manera multifacética, comprender mejor las existencias del museo y rastrear especímenes para obtener préstamos. Los números de especímenes únicos permiten el seguimiento individual, y los otros campos DwC proporcionan múltiples áreas para una búsqueda y recuperación precisas.
Para la interfaz de búsqueda web de CalBug, los especímenes conservan su jerarquía de clasificación dentro de la base de datos. Sin embargo, los campos de búsqueda orientados hacia el exterior tienen como objetivo servir a un público más amplio, no solo al administrador de colecciones y al personal del museo. Así, la aplicación de búsqueda organiza los recursos por tercera vez “en la salida” de la base de datos en respuesta a una consulta de usuario. Como este diseño está optimizado para investigadores y estudiantes, la clasificación parece centrarse más en taskonomy en lugar de en la taxonomía institucional (ver Figura: Interfaz de búsqueda CalBug). Los 20 campos de búsqueda proporcionados en la interfaz de búsqueda, mientras que realmente buscan a través de los ~100 campos en la base de datos, facilitan la recuperación precisa de la información. Aunque menos campos de búsqueda podrían producir menor precisión, las pruebas de usuario han demostrado que el nuevo diseño de búsqueda mejora la precisión al no requerir que los usuarios sepan exactamente qué campo DwC consultar.
Esta tabla de paso de peatones mapea los campos en la interfaz de búsqueda CalBug a las columnas de base de datos subyacentes
La búsqueda se amplía aún más al tener un cuadro 'Buscar en cualquier campo', que literalmente busca en cada campo DwC un término, así como un campo de “Nombre común”, para apoyar búsquedas de novatos, como “escarabajo” y “mariposa” en lugar de “coleópteros” y “ lepidópteros. ” Las propiedades intrínsecas de los especímenes dan los resultados a la clasificación simple (alfabética y numérica) así como al filtrado (a través de la opción “Refinar”) en la vista de lista de las páginas de resultados. Vistas adicionales de los resultados, incluyendo una vista de mapa que muestra las ubicaciones de las colecciones y una vista de cuadrícula que muestra fotos de especímenes, ayudan a los usuarios a localizar especímenes deseados y reorganizarse según sea necesario para satisfacer sus
Notas: 1. http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/WebHome