2.8: Soluciones para problemas seleccionados

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Ejercicio 2.1.1:

Ejercicio 2.1.2:

Ejercicio 2.1.3:

A pH neutro, la lisina normalmente estaría protonada. Noy tendría un par solitario en el nitrógeno para coordinar un ion metálico.

Ejercicio 2.4.6:

El pK a de _una posición α suele ser de aproximadamente 20, aunque puede variar dependiendo de qué otros grupos estén cerca. Eso es demasiado alto para acumular una cantidad significativa de las especies desprotonadas en el agua, que tiene _un pK a (en agua) de 14.

Ejercicio 2.4.7:

El pK _a de la cadena lateral de histidina es aproximadamente 6.0; al cambiar de pH 7 a pH 5, este grupo se protonaría y cargaría positivamente. La carga positiva sería más estabilizante (o menos desestabilizante) hacia Fe ²⁺ que Fe ³⁺; el potencial de reducción aumentaría.
El pK _a de la cadena lateral de histidina es aproximadamente 3.7; al cambiar de pH 4 a pH 3, este grupo se protonaría y se cargaría positivamente. La carga positiva sería más estabilizante (o menos desestabilizante) hacia Fe ²⁺ que Fe ³⁺; el potencial de reducción aumentaría.
El pK _a de la cadena lateral de histidina es aproximadamente 4.2; al cambiar de pH 4 a pH 5, este grupo se desprotonaría y cargaría negativamente. La carga negativa sería más estabilizante (o menos desestabilizante) hacia Fe ³⁺ que Fe ²⁺; el potencial de reducción disminuiría.

Ejercicio 2.5.1:

Ti ⁴⁺ y Ca ²⁺

Ejercicio 2.5.2:

F ^- y HO ^-

Ejercicio 2.5.3:

Co ²⁺ con NO ₂ ^-
Mg ²⁺ con CH ₃ CO ₂ ^-
Cu ⁺ con RS ^-
Fe ²⁺ con N ₂
Zn ²⁺ con imidazol

Ejercicio 2.5.4:

Elige la mejor combinación para los siguientes iones metálicos.

Fe ³⁺ con asp
Cu ⁺ con met
Zn ²⁺ con su
Cu ²⁺ con su
Co ³⁺ con glu

Ejercicio 2.5.5:

Elija el residuo de aminoácido que tendría el efecto sobre el ión metálico como se describe, basado en los principios de HSAB.

Incrementar el potencial de reducción de Cu ²⁺: met.
Disminuir el potencial de reducción de Fe ³⁺: glu.
Hacer Cu ⁺ más fácil de oxidar: el suyo.
Hacer Fe ²⁺ más fácil de oxidar: asp.
Hacer Fe ³⁺ más fácil de reducir: cys.

Ejercicio 2.7.1:

a) 0 β b) 1.73 β c) 2.83 β d) 3.87 β e) 4.89 β f) 5.92 β

Ejercicio 2.7.2:

a) aprox. 4 β b) aprox. 4 β c) aprox. 2 β d) aprox. 3 β

e) aprox. 5 β f) aprox. 0 β g) aprox. 6 β