22.8: Direcciones actuales de investigación

Última actualización
Guardar como PDF

Page ID: 54944

\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)\(\newcommand{\AA}{\unicode[.8,0]{x212B}}\)

LADs

(a) 30% del genoma es variable entre tipos celulares, cómo podemos diferenciar estas diferencias

b) ¿Cómo interactúan la lámina y los LAD? ¿Hay alguna atracción entre los LADs y estos dominios, o se basa en la repulsión del interior?

TAD y otros compartimentos:

a) ¿Cuál es la base biológica de los compartimentos? ¿Existe algún componente multifacético de los compartimentos?

b) ¿Cómo funcionan los cohesinos? ¿Son suficientes los pares de cohesina-extrusión para explicar todos los dominios?

(c) ¿Los bucles mejorador-promotor están confinados a dominios específicos? ¿Son estos componentes dinámicos?/¿Son bucles arquitectónicos mediados por CTCF?

Otros/Misceláneos:

a) ¿Cómo relacionamos los diferentes componentes cromosómicos (es decir, LAD, TAD, dominio polycomb, orígenes de réplica, modificaciones de histonas, expresión génica)?

b) Bases evolutivas de la arquitectura genómica: ¿hubo una presión evolutiva y cuándo surgieron los principios del plegamiento?

¿Sabías?

¡Esta pregunta ha sido abordada (parcialmente)! Al investigar células que pasan por múltiples rondas de diferenciación, se ha observado que algunas regiones se localizarán a la lámina en la primera diferenciación pero ¡no quedarán reprimidas hasta la segunda diferenciación!

Hipótesis de guardia corporal

La hipótesis del guardaespaldas fue propuesta en 1975 por Hsu TC. Sugiere que el ADN inactivo se localiza en la periferia del núcleo para que pueda 'proteger' las regiones importantes y activas del ADN de peligros extraños como virus o radicales libres. Los intentos de probar la hipótesis introduciendo daño artificial en el ADN han producido resultados circunstanciales, y la pregunta permanece abierta. Experimentos unicelulares

Se sabe que las células conservan su organización original después de la mitosis, como lo demuestran los experimentos de tinción cromosómica. Sin embargo, experimentos recientes han demostrado que puede haber una gran diferencia en la organización entre las células madre e hija. Ciertas propiedades globales, como los territorios cromosómicos, se conservan, pero la organización en un detalle más fino puede diferir mucho. La experimentación unicelular es una técnica emergente que puede ser capaz de abordar esta pregunta abierta.

FAQ

P: ¿Alguien ha intentado incrementar la expresión de un gen en medio de un LAD? ¿Qué pasó?

R: No está claro si existe un ejemplo específico de esto, sin embargo se han realizado varios estudios relacionados. Los investigadores han intentado 'atar' una región de ADN a la lámina nuclear para ver si se desactiva espontáneamente. Sin embargo, los resultados no fueron concluyentes ya que en la mitad de los casos la región se volvería inactiva y en la otra mitad ¡no lo haría! Hasta el momento este tipo de manipulaciones no han dado mucho, pero se encontró que si un segmento de ADN desprovisto de proteínas se digirió y se mezclaba con proteínas de lámina altamente purificadas, los fragmentos unidos revelan un patrón muy similar al de los LAD. Esto nos dice que la lámina se une directamente al ADN. Sin embargo, esto parece variar entre especies.