27.3: Gráficas de Recombinación Ancestral

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En la Figura 28.24 a, los dos cromosomas en la parte superior representan los cromosomas homólogos de un progenitor. El cromosoma rojo representa la información genética de la madre y el cromosoma azul representa la información genética del padre (de la generación de abuelos). Sin cruzamientos (recombinación), el progenitor transmitirá la información genética roja o azul a la descendencia. En realidad, la recombinación ocurre durante la meiosis para que uno de los padres transmita alguna información genética de ambos abuelos, transmitiendo efectivamente una mejor representación de la información genética del padre.
En cada generación, un evento de recombinación puede ocurrir en cualquier loci. La historia evolutiva de la recombinación se puede rastrear a través de una gráfica secuencial de árboles, de tal manera que el árbol i-ésimo en la gráfica representa la recombinación en el i-ésimo locus.

Rellene esta sección con base en: www.Eecs.Berkeley.edu/yss/pub/sh-jcbo5.pdf y las notas del curso de 2012. Se podría agregar más sobre este tema en el futuro

El coalescente secuencial de Markov

El modelo coalescente secuencial de Markov aborda el papel de la recombinación en la construcción de árboles. Con recombinación involucrada, una secuencia puede tener dos progenitores, lo que complica la construcción. El modelo coalescente secuencial de Markov nos dice que moverse secuencialmente de izquierda a derecha es un enfoque más simple y mucho más eficiente para analizar el árbol; el enfoque esencialmente divide el árbol en árboles locales y los superpone para describir eventos de recombinación. Se pueden leer más en el siguiente trabajo:

Elaborar sobre las complejidades del modelo en sí: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21270390