30.8: Herramientas y Técnicas
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- HapMap, un completo catálogo de SNP humanos.
- PLINK, un conjunto de herramientas GWAS C/C++ de código abierto que puede analizar grandes conjuntos de datos con cientos de
miles de marcadores genotipados para miles de individuos para examinar posibles vías.
- GRASS (Gene set Ridge regression in Association Studies), resume la estructura genética de cada gen como EigenSNP y utiliza regresión de cresta grupal para seleccionar los propios SNP representativos para cada gen, evaluando su asociación con el riesgo de enfermedad y reduciendo la alta dimensionalidad de los datos de GWAS.
- GWAMA (Genome-Wide Association Meta-Analysis), realiza metaanálisis de GWAS de fenotipos dicoto-mous o rasgos cuantitativos.