4.E: Genomas y Cromosomas (Ejercicios)
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4.3
(BPA) Responda las siguientes preguntas con referencia a la siguiente figura.
Figura para 4.3 Reasociación de ácidos nucleicos, cizallados a fragmentos de 500 nucleótidos, de diversas fuentes [Derivado de R. J. Britten y D. Kohne, Science, 161, 529 (1968).]
- ¿Cuántas de estas preparaciones de ADN contienen más de una clase de secuencias de frecuencia? Explica tu respuesta.
- Si se toma que el tamaño del genoma de E. coli sea de 4.5 x 106 pares de nucleótidos, ¿cuál es el tamaño del genoma de T4?
- ¿Cuál es la complejidad del ADN satelital de ratón?
- El ADN satélite de ratón representa el 10% del genoma del ratón. ¿Cuál es el número de repetición para las secuencias satélites de ratón, dado que el tamaño del genoma haploide es de 3.2 x 109 pares de nucleótidos?
- El genoma del ternero es del mismo tamaño que el genoma del ratón. ¿Qué fracción del genoma del ternero está compuesta por secuencias únicas?
4.4
Imaginemos que obtuviste una muestra de ADN de un armadillo y midiste la cinética de renaturalización del ADN genómico. También se renaturalizó un estándar de ADN bacteriano (N = 3 x 106 pb) en idénticas condiciones. Se observaron tres componentes cinéticos en la curva armadillo ADN C 0 t, renaturalizándose rápido, medio o lento. La fracción del genoma ocupada por cada componente (f) y el valor C 0 t para la semirrenaturalización (C o t 1/2 (medido)) son los siguientes:
| Componente | f | C o t 1/2 (medido) |
|---|---|---|
| rápido | 0.2 | \(10^{-4}\) |
| mediano | 0.4 | \(10^{-1}\) |
| lento | 0.4 | \(10^{4}\) |
- Utilice la información proporcionada para calcular el C o t 1/2 (puro), la complejidad (N) y la frecuencia de repetición (R) para cada componente. Supongamos que el componente renaturalizante lentamente es de una sola copia.
- Calcular el tamaño del genoma (G) del armadillo bajo el supuesto de que el componente renaturalizante lentamente es una sola copia.
- ¿Cuál de las siguientes secuencias podría ser miembro del componente renaturalizante rápido?
GACTCAGACTCAGACTCA
ATATATATATATATATATAT
ACTGCCACGGGATACTGC
GCGCGC