12.3: Se utilizan múltiples mecanismos para empalmar diferentes tipos de intrones
- Page ID
- 58555
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \)
\( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)
\( \newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\)
\( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\)
\( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\)
\( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\)
\( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
\( \newcommand{\id}{\mathrm{id}}\)
\( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
\( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\)
\( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\)
\( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\)
\( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\)
\( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\)
\( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\)
\( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\)
\( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\AA}{\unicode[.8,0]{x212B}}\)
\( \newcommand{\vectorA}[1]{\vec{#1}} % arrow\)
\( \newcommand{\vectorAt}[1]{\vec{\text{#1}}} % arrow\)
\( \newcommand{\vectorB}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \)
\( \newcommand{\vectorC}[1]{\textbf{#1}} \)
\( \newcommand{\vectorD}[1]{\overrightarrow{#1}} \)
\( \newcommand{\vectorDt}[1]{\overrightarrow{\text{#1}}} \)
\( \newcommand{\vectE}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash{\mathbf {#1}}}} \)
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \)
\( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)
Diferentes Tipos de Intrones
Se han identificado al menos cuatro clases distintas de intrones: Intrones en genes codificadores de proteínas nucleares que se eliminan mediante spliceosomas (intrones de spliceosomal) Intrones en genes de ARN de transferencia nuclear y arqueal que se eliminan por proteínas (intrones de ARNt) Intrones del grupo I de autocorte y empalme que se eliminan por ARN catálisis.
- Pre‑ARNt
- grupo I, grupo II: Los intrones en genes mitocondriales fúngicos y en genes plastidios (cloroplastos) se han agrupado en dos grupos diferentes a partir de diferentes secuencias consenso encontradas en los intrones. Como veremos a continuación, los intrones del grupo II tienen un mecanismo de corte y empalme similar al del pre-ARNm.
- Pre-ARNm
En todos los casos, el empalme eliminará los intrones y unirá los exones para dar el ARN maduro.
| Clase | Distribución | Secuencia | Característica distintiva | Mecanismo |
|---|---|---|---|---|
| Pre-ARNt | levaduras a mamíferos | muy corto (10-20 nucleótidos) | requiere ATP | corte, cinasa, ligasa |
| grupo I | mitocondrias fúngicas, plastidios, pre-ARNr en Tetrahy mena | consenso característico | autoempalme, nucleota (s) G ide (s) para iniciar | transferencia de fosfoéster |
| grupo II | mitocondrias fúngicas, plastidios | consenso característico | puede autoempalmar, nucleótido A interno para iniciar | transferencia de fosfoéster |
| Pre-ARNm | levaduras a mamíferos | 5' GU... AG 3' | spliceosoma (ATP para ensamblaje), nucleótido A interno para iniciar | transferencia de fosfoéster |
Empalme de pre‑ARNt
Algunos ARNt precursores contienen intrones cortos (solo de 10 a 20 nucleótidos) sin secuencias consenso aparentes. Estos intrones cortos se eliminan en una serie de etapas catalizadas por enzimas que incluyen una endonucleasa, una quinasa y una ligasa. Debido a que la endonucleasa genera un producto fosfodiéster cíclico 2', 3', se necesita una fosfodiesterasa adicional para abrir el fosfodiéster cíclico para proporcionar el hidroxilo 3' para la reacción de ligasa. Además, el 2'-fosfato (producto de la fosfodiesterasa) debe ser eliminado por una fosfatasa. Este proceso utiliza dos ATP para cada evento de empalme.
