3.6: Dominios, Motivos y Pliegues Proteicos en la Estructura Proteínica

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Las estructuras de dos proteínas diferentes que se muestran a continuación comparten un dominio común de PH (homología de Pleckstrin) (granate).

Estas dos y muchas otras proteínas tienen este dominio, lo que les permite unirse a una molécula de fosfatidil-inositol trifosfato que se genera como parte de una vía común de señalización celular. La implicación de este dominio común es que una célula puede tener vías de señalización que le permitan responder a diferentes señales que conducen a la misma respuesta, aunque bajo diferentes condiciones y probablemente en diferentes momentos. Las proteínas se describen típicamente como consistentes en varias subestructuras distintas, discutidas a continuación.

A. Dominios

Un dominio estructural es un elemento de la estructura general de la proteína que es estable y a menudo se pliega independientemente del resto de la cadena proteica. Al igual que el dominio PH anterior, muchos dominios no son exclusivos de los productos proteicos de un gen, sino que aparecen en una variedad de proteínas. Las proteínas que comparten más de unos pocos dominios comunes son codificadas por miembros de genes relacionados evolutivamente que comprenden familias de genes. Los genes para proteínas que comparten solo uno o algunos dominios pueden pertenecer a superfamilias génicas. Los miembros de la superfamilia pueden tener una función en común, pero sus secuencias no están relacionadas. Los nombres de dominio a menudo derivan de su función biológica prominente en la proteína a la que pertenecen (por ejemplo, el dominio de unión a calcio de la calmodulina), o de sus descubridores (¡el dominio PH!). El intercambio de dominios que da lugar a familias de genes y superfamilias son eventos genéticos naturales. Porque los dominios proteicos también pueden ser “intercambiados” por ingeniería genética para hacer proteínas quiméricas con funciones novedosas.

137 Estructura y función del dominio de la proteína

B. Motivos

Los motivos proteicos son pequeñas regiones de estructura tridimensional proteica o secuencia de aminoácidos compartida entre diferentes proteínas. Son regiones reconocibles de estructura proteica que pueden (o no) estar definidas por una función química o biológica única.

C. Estructura Supersecundaria

La estructura supersecundaria se refiere a una combinación de elementos estructurales secundarios, como las unidades beta-alfa-beta o el motivo hélice-vuelta-hélice. También pueden ser referidos como motivos estructurales. Estructura supersecundaria “Google” para ejemplos.

D. Pliegues proteicos

Un pliegue proteico se refiere a un aspecto general de la arquitectura proteica, como haz de hélice, barril beta, pliegue de Rossman u otros “pliegues” proporcionados en la base de datos de Clasificación Estructural de Proteínas. Haga clic en Pliegues de proteínas para leer más sobre estas estructuras.