Saltar al contenido principal
LibreTexts Español

1.2: Proyecto Final - Introducción a la Investigación en Biología Computacional

  1. Última actualización
  2. Guardar como PDF
  • Page ID
    54860

    • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)\(\newcommand{\AA}{\unicode[.8,0]{x212B}}\)

    Objetivos finales del proyecto

    Un componente importante de ser biólogo computacional es la capacidad de realizar investigaciones independientes en el área. Las habilidades para un investigador exitoso difieren de una persona a otra, pero en el proceso de impartir este curso, hemos identificado varios aspectos que todos son necesarios, y hemos establecido actividades para un proyecto a largo plazo, que permitan a los estudiantes llevar a cabo su investigación independiente.

    El proyecto refleja el proceso científico del mundo real: idear una idea → enmarcarla → proponerla → revisarla → llevarla a cabo → presenta tus resultados. Se espera que los estudiantes piensen críticamente sobre su propio proyecto, y también evalúen propuestas de investigación entre pares y, por último, respondan a los comentarios de sus compañeros.

    Se espera que los estudiantes utilicen datos reales y presenten sus resultados en formato de conferencia. El objetivo final es la investigación publicable. Se anima a los estudiantes a platicar con el personal del curso mientras formulan una idea final del proyecto, mirar de cabeza a través de los diversos capítulos y módulos, y hacerse una idea de qué áreas le interesarán más.

    Hitos finales del proyecto

    En lugar de esperar hasta el final del trimestre para comenzar la lluvia de ideas o proporcionar retroalimentación, comenzamos las actividades del proyecto con el primer conjunto de problemas, para identificar problemas de interés y tipos de proyectos, encontrar socios, hablar con estudiantes actuales y posdoctorados en biología computacional que puedan servir como mentores, y diseñar un plan de investigación al estilo de una propuesta de los NIH para identificar los posibles escollos tempranamente y abordarlos o resolverlos antes de que se conviertan en un cuello de botella.

    Al establecer varios hitos de progreso incremental a lo largo del trimestre, junto con la tutoría y retroalimentación a lo largo del semestre, hemos logrado avances consistentes en años anteriores, lo que puede ser útil para los estudiantes que asuman un nuevo proyecto en cualquier etapa de su carrera. Los proyectos de investigación de este curso en el pasado han sido utilizados como punto de partida para un artículo publicado, han dado lugar a tesis de maestría y doctorado, y han obtenido premios tanto académicamente como en conferencias.

    El cronograma para el proyecto final es el siguiente:
    1. Configuración: una breve descripción de su experiencia e interés. Vencido 9/29
    2. Lluvia de ideas: una lista de ideas y socios iniciales del proyecto. Vencido 10/6
    3. Propuesta: presentar una propuesta de proyecto en forma de propuesta de NIH. Vencido 10/20

    4. Presentación de la propuesta: presentar diapositivas a clase y mentores sobre la propuesta. Vencido 10/23 5. Revisión: revisión y crítica de 3 propuestas de pares. Vencido 10/30
    6. Informe de avance de mitad de período: escribir esquema del informe final. Vencido 11/19
    7. Informe Final del Proyecto: escribir informe en formato de ponencia de conferencia. Vencimiento 12/6

    8. Presentación de Clase Final: plática de conferencia de 10min. Vencimiento 12/10

    Habrá sesiones de mentoría los viernes antes de que venza cada parte del proyecto final, y se le anima a encontrar un mentor en las primeras sesiones que esté activamente interesado en su proyecto y pueda ayudarlo con más frecuencia. Las sesiones de tutoría pueden ser útiles para identificar si los resultados inesperados son el resultado de un error o, en cambio, son un descubrimiento.

    Asegúrate de comenzar a trabajar en el proyecto incluso mientras esperas las revisiones por pares, para que tengas 4-5 semanas para completar la investigación en sí.

    Entregables del proyecto

    El proyecto final incluirá los siguientes dos entregables:

    1. Una presentación escrita, con vencimiento el lunes a las 8 pm, la semana pasada de clases. La presentación escrita puede contener los siguientes elementos:

      • Quién hizo qué (para reflejar la tendencia en las publicaciones)
      • La experiencia general del proyecto
      • Tus descubrimientos
      • Lo que aprendiste de la experiencia (introspección)

    2. Una presentación oral, que vence el jueves después de la presentación escrita. Esto permite a los estudiantes tres días para preparar la presentación oral.

    Graduación de proyectos

    Seleccionar un proyecto que tenga éxito puede ser difícil. Para ayudar a los estudiantes a optimizar para un proyecto exitoso, les informamos de antemano el esquema de calificación, diseñado para maximizar el impacto del proyecto al ser original, desafiante y relevante para el campo, pero por supuesto, la calificación depende en última instancia del logro general y la claridad de presentación.

    Brevemente, la ecuación de calificación para el proyecto final es:

    min (O, C, R) ×A+P

    donde

    Originalidad: los experimentos computacionales no originales no se publican

    Desafío: el proyecto tiene que ser lo suficientemente difícil

    Relevancia - tiene que ser de la biología, no puede simplemente reutilizar algo de otro campo

    Logro - si no logras nada no obtendrás una buena calificación

    Presentación - aunque hayas logrado un buen proyecto tienes que poder presentarlo para que todos lo sepan, y que se vea fácil. La presentación debe mostrar cómo el proyecto es O, C y R.

    Originalidad, Desafío, Relevancia son cada uno de 5 puntos, Logro y Presentación son cada uno de 10.

    This page titled 1.2: Proyecto Final - Introducción a la Investigación en Biología Computacional is shared under a CC BY-NC-SA 4.0 license and was authored, remixed, and/or curated by Manolis Kellis et al. (MIT OpenCourseWare) via source content that was edited to the style and standards of the LibreTexts platform; a detailed edit history is available upon request.