11.1: Introducción

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Muchas ideas en biología se basan en conocer los niveles de proteína en una célula. La abundancia de proteínas a menudo se extrapola de los niveles de ARNm correspondientes. Esta extrapolación se realiza ya que es relativamente fácil medir los niveles de ARNm. Además, durante mucho tiempo, se pensó que toda la regulación de la expresión ocurrió antes de la formación del ARNm. Ahora, se sabe que la expresión sigue siendo regulada en la etapa de traducción. La Figura 1 muestra que los datos disponibles para la regulación postranscripcional son mínimos e ilustra un ejemplo de cómo los niveles de ARNm no son indicativos de la abundancia de proteínas.

Screen Shot 2020-08-23 a las 10.11.27 AM.png — Figura 11.1: El ARNm no siempre es un proxy apropiado para los niveles de proteína.

Existen muchos factores que pueden estar afectando la forma en que se traduce el ARNm, provocando que el nivel de ARNm no esté directamente relacionado con los niveles de proteína. Estos factores incluyen:

Tasas de elongación de la traducción
- depende del sesgo de uso de codones, adaptación de ARNt y edición
Tasas de iniciación de la traducción
: depende de la frecuencia AUG, la presencia TOP, el tipo de iniciación (dependiente de CAP/IRE) y las estructuras secundarias
Tasas de terminación de la traducción
- depende de la identidad del codón
Tasas de degradación del ARNm
: depende de la longitud de la cola de poliA, el tapado, la edición del ARNm y la
Tasas de degradación de proteínas
: depende de las secuencias PEST, la estabilidad de las proteínas, las regiones no estructuradas y la presencia de aminoácidos polares
Elementos reguladores cis y trans
- depende de elementos ricos en UA, miARN, ARNc y proteínas de unión a ARN

Figura 11.2: Discrepancia entre los niveles de ARNm y la abundancia de proteínas.