14.3: La biología de la secuenciación de ARNm
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El primer paso en la secuenciación del ARNm es lisar las células de interés. Esto crea una masa de proteínas, nucleótidos y otras moléculas que luego se filtran para que solo queden moléculas de ARN (o específicamente ARNm). Los transcritos resultantes se fragmentan en lecturas de 200-1000 pares de bases de largo y se someten a una reacción de transcripción inversa para construir una biblioteca de ADN específica de cadena. Finalmente, ambos extremos de estos fragmentos de ADN se secuencian. Después de establecer estas lecturas secuenciadas, la parte computacional de RNA-seq se puede dividir en tres partes: mapeo de lectura, reconstrucción y cuantificación.