12.7: Empalme de intrones del grupo II
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- Mecanismo similar al del empalme nuclear previo al ARNm.
- Puede ocurrir por autoempalme, aunque en condiciones bastante artificiales.
- La reacción puede ser reversible (al igual que el empalme de intrones del grupo I), lo que lleva a la idea de que estos intrones pueden ser elementos transponibles.
- El autoempalme del grupo II puede ser el antepasado evolutivo del empalme nuclear de pre-ARNm
I. Similaridades mecanicistas para el empalme de intrones del grupo I, del grupo II y del pre-ARNm
1. Todos implican transesterificación = transferencias de fosfoéster. No se utilizan enlaces de alta energía en el proceso de empalme; la disposición de los enlaces fosfodiéster se reorganiza y como resultado los exones se unen entre sí.
2. El nucleófilo iniciador es el OH 3' de un nucleótido guanina para intrones del Grupo I, mientras que para los intrones e intrones del Grupo II en pre-ARNm, es el 2' OH de un nucleótido adenina interno en el intrón.
3. En todos los casos, se utilizan estructuras secundarias particulares en los ARN para reunir los componentes reactivos (por ejemplo, extremos de exones e intrones). Estas estructuras secundarias pueden ser intramoleculares en el caso de intrones autoempalmados del Grupo I y del Grupo II, o pueden ser intermoleculares en el caso del pre-ARNm y los ARNsn, por ejemplo, los de los snRNP U1, U2, quizás U6.
