12.18: Laboratorio de Neurociencia

Por Colin Gerber, diciembre de 2013.

Visión general. Un laboratorio de neurociencia está haciendo una investigación sobre la enfermedad de Parkinson en la que realizan experimentos con ratas. Utilizan diferentes tipos de ratas, cirugías y medicamentos para experimentos y tienen que realizar un seguimiento de toda esta información para el análisis de datos, publicaciones e inspectores de laboratorio.

El sistema de organización existente se desarrolló antes de que prevalecieran las computadoras personales y ha evolucionado lentamente con el tiempo. Sin embargo, gran parte de la estructura subyacente del sistema todavía tiene sus raíces en conceptos preinformáticos. Con el fin de actualizar el sistema para incorporar tecnologías más modernas ¿cuáles son los cambios en los recursos, sus descripciones y la estructura de sistemas que hay que hacer?

¿Qué se está organizando? Los recursos en el sistema de organización actual incluyen ratas, cirugías, experimentos, medicamentos y datos registrados de los experimentos. Hay algunos otros recursos que podrían incorporarse al sistema de organización.

Equipo de Investigación en Neurociencia

Los recursos físicos en el laboratorio del autor están dispuestos para facilitar la precisión precisa de las interacciones requeridas en la investigación médica. En esta foto, se instala una matriz de amplificadores y filtros para procesar y registrar señales de ondas cerebrales de ratas (izquierda) en un rack vertical que se puede ubicar cerca del equipo utilizado para realizar cirugías.

(Foto de Colin Gerber. Usado con permiso.)

Uno de esos nuevos recursos son las técnicas de cirugía. Históricamente, las técnicas de cirugía han sido transmitidas por el método maestro aprendiz y la información fue en gran parte conocimiento tácito que tenían los investigadores que realizaban las cirugías y no explícitamente en el sistema. Esto se hizo porque es intrínsecamente difícil almacenar las complejidades de la cirugía en el texto y aún más difícil para un nuevo investigador aprender a realizar la cirugía a partir de información textual. Sin embargo, la capacidad de almacenar y anotar multimedia cambia esto. Ahora es posible hacer videos instructivos para cada tipo de cirugía, agregar descripciones de recursos al archivo de video y almacenarlo en el sistema organizador.

También hay un recurso que se trata como un recurso a lo largo de toda su vida útil cuando en realidad puede ser dos. Cuando las ratas son introducidas originalmente en el sistema de organización, son tratadas como una manifestación del tipo de recurso de rata. Es decir, las ratas son intercambiables, puedes usar cualquier rata de ese grupo en tu cirugía. Una vez realizada la cirugía, la rata se modifica en una nueva instancia de recurso. La rata específica en la que se realizó la cirugía ahora tiene un nuevo conjunto de descripciones de recursos.

¿Por qué se está organizando? ¿El propósito principal del sistema de organización es asegurarse de que se utilicen las ratas correctas en cada experimento diferente? ¿O es para asegurarse de que los registros se mantengan actualizados para los inspectores de laboratorio? También podría estar haciendo más eficiente el análisis de datos y la escritura en papel. Estas decisiones afectarán cuántos tipos diferentes de descripciones de recursos se requieren y la granularidad necesaria para esas descripciones.

Este sistema es solo uno de los muchos sistemas de organización dentro de un laboratorio, por lo que es muy importante decidir el alcance y las interacciones que tendrá con los otros sistemas de organización. Una decisión importante es si el sistema apoyará la capacitación de nuevos miembros del laboratorio o no. Tener recursos como la grabación de video de cirugías y experimentos podría permitir interacciones de enseñanza para nuevos investigadores. Pero hay muchos otros aspectos de la formación que debe atravesar un nuevo investigador, ¿deberían incluirse estos también en el sistema de organización? De ser así, haría que el sistema fuera mucho más complejo y ampliaría el alcance del sistema organizador fuera de cirugías y experimentos pero mantendría todo el recurso docente en un solo sistema.

Otra opción sería contar con un sistema de organización separado que se encargue del material de capacitación que sea capaz de interactuar con los multimedia en el sistema que sean relevantes para la capacitación. Esto no amplía el alcance del sistema sino que dificultaría más el mantenimiento del mismo. Cada vez que se cambia una técnica quirúrgica o experimento se tendrían que actualizar dos sistemas para tener en cuenta los cambios.

¿Cuánto se está organizando? Al sistema se accede por muchos tipos de usuarios, cada uno requiriendo un tipo diferente de interacción. Los investigadores necesitan buscar la técnica correcta de rata y cirugía. El inspector de laboratorio necesita verificar los registros de medicamentos y asegurarse de que todos los métodos y equipos quirúrgicos estén actualizados. El investigador principal necesita ver una visión general de los avances en los proyectos.

Actualmente el sistema está organizado en categorías jerárquicas donde las categorías de nivel superior son la cirugía y los experimentos. Esta organización facilita la recuperación de recursos específicos. Sin embargo, las interacciones que normalmente se realizan con el sistema utilizan recursos de ambos subárboles, lo que hace que el enfoque jerárquico sea menos que óptimo.

Un enfoque de clasificación facetada podría funcionar bien para permitir estas interacciones. Las facetas incorporarían las categorías originales de cirugía y experimentos pero también agregarían facetas para cada tipo común de interacción. En este caso, las diferentes descripciones de recursos del mismo recurso a menudo se clasificarán en diferentes facetas. Estas descripciones de recursos a menudo actuarán como recursos ellos mismos. Por ejemplo, un inspector de laboratorio está interesado en recuperar la fecha de vencimiento y las horas en que se usó un medicamento en cirugía, no el medicamento en sí.

¿Cuándo se está organizando? En un laboratorio de neurociencia las descripciones de los recursos a menudo se pierden si no se registran en el momento en que se miden. Por ejemplo, si se pesa a una rata para calcular la dosis correcta de un medicamento, se debe ingresar al sistema tanto la dosis como el peso. Si no se ingresa el peso al momento de la medición sería imposible pesar a la rata más tarde y obtener el mismo resultado (ya que la rata cambia de peso con el tiempo). Este es un problema común, por lo que como regla general todos los recursos y descripciones deben ingresarse al sistema en el momento en que se adquieren.

¿Cómo o por quién se está organizando? Los investigadores que trabajan en el laboratorio hacen toda la organización. Ellos son los que crean nuevos recursos, descripciones y tienen el mayor conocimiento sobre los recursos y cómo se relacionan entre sí.

Otras consideraciones. Cambiar el sistema e ingresar todos los datos en el momento de la medición inicialmente causará más trabajo para los investigadores, pero resultará en una mayor precisión para las interacciones respaldadas por el sistema y menos trabajo de recuperación durante el análisis de datos y la escritura en papel.