21.6: Reconocimiento y Unión de Proteínas
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Enzima/Sustrato
Llave y llave (Emil Fisher)
- Destaca la complementariedad de formas
- Sustrato típicamente rígido
- Conceptos arraigados en la estructura inicial y final
- No aborda directamente el reconocimiento
Pero las reacciones de unión a proteínas típicamente implican cambios conformacionales. La flexibilidad del dominio puede dar lugar a un aumento dramático en la afinidad de unión. Puede ser necesario un cambio/fluctuación conformacional significativo para permitir el acceso al bolsillo de encuadernación.
Para unir un sustrato, dos modelos varían en el orden de eventos para el cambio conformacional frente al evento de unión:
- Ajuste inducido (Daniel Koshland)
- Selección conformacional:El equilibrio preexistente estableció d urante que enzima explora una variedad de conformaciones.
Interacciones Proteína-Proteína
- Apreciación de que la estructura no es la única variable
- Plegado y encuadernación acoplados
- Doblar en contacto
- Fly-casting
- Ambos socios pueden ser flexibles