21.7: Encuadernación de Guiado
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Electrostática
- La electrostática juega un papel a largo y corto alcance
- Las interacciones inespecíficas de largo alcance aceleran el encuentro difusivo
- Guías de corto alcance contactos específicos
- Complementariedad electrostática
- Dirección electrostática
- van der Waals, apilamiento π-π
Forma y Geometría
- Complementariedad de forma
- Registro orientacional
- Plegable
- Residuos de anclaje
Enlace de hidrógeno
- Corto alcance
- Cruce de transferencia electrostática a más carga con HBs fuertes (como ADN, unión proteína-ADN)
- Importante en especificidad
Solvación/Desolvación
- Para unirse, un ligando necesita desolvar el sitio activo
- Los contactos bimoleculares desplazarán el agua
- Agua a menudo íntima vinculante participante (aguas cristalográficas)
- Parches hidrofóbicos
- Reconfiguración de carga en soluciones electrolíticas en la interfaz de unión
- Fuerzas electrostáticas del agua
Fuerzas de Agotamiento
- Efecto entrópico
- Fluctuaciones que conducen a un desequilibrio de fuerzas que impulsa las partículas juntas
- Crowding/Enjaulamiento
- Hidrofobicidad
- Deshumectación y fluctuaciones interfaciales
- El trastorno aumenta el volumen hidrodinámico
- Plegado y encuadernación acoplados
- Mecanismo de fly-casting
- Socios parcialmente desplegados
- Interacción no nativa de largo alcance
- Disminución gradual de la energía libre
- Mecanismo de fly-casting
