21: Vinculación y Asociación
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Las asociaciones moleculares están en el centro de los procesos biológicos. Las interacciones funcionales específicas están presentes en cada nivel de actividad celular. Algunos de los más importantes:
1) Proteínas que interactúan con moléculas pequeñas e iones
- Interacciones enzima/sustrato y catálisis
- Unión ligando/receptor
- Transducción química de energía (por ejemplo ATP)
- Señalización (por ejemplo, neurotransmisores, AMPc)
- Unión a fármacos o inhibidores
- Antigeno de unión a anticuerpos
- Transporte de moléculas pequeñas y iones
- Mb+ O2 → MbO2
- Canales iónicos y transportadores
2) Interacciones Proteína-Proteína
- Redes de señalización y regulación
- Los receptores que se unen a ligandos activan receptores
- Los GPCR se unen a agonista/hormona para la transducción de señales transmembrana
- Ensamblaje y función de complejos multiproteicos
- La maquinaria de replicación en replisoma consiste en múltiples proteínas que incluyen ADN polimerasa, ADN ligasa, topoisomerasa, helicasa
- Cinetocoros orquestan las interacciones de la cromatina y las proteínas motoras que separan a las cromátidas hermanas durante la división celular
3) Interacciones proteína-ácido nucleico
- Todos los pasos en el dogma central
- Unión al factor de transcripción
- Maquinaria de reparación de ADN
- Ribozimas
En todos estos ejemplos, el hilo conductor es una macromolécula, que normalmente ejecuta un cambio conformacional durante el proceso de interacción. La flexibilidad conformacional y los cambios de entropía durante la unión juegan un papel importante en la descripción de estos procesos.